Kod imunokompetentnih subjekata, općenito, nije potreban poseban tretman za toksoplazmozu . Bolest se gotovo uvijek spontano rješava u roku od nekoliko mjeseci; ako je potrebno moguće je primijeniti simptomatske terapije.
Kod imunodeprimiranih pojedinaca i prirođenih oblika, liječenje kombinacijom pirimetamina i sulfadiazina, kombinirano s folinskom kiselinom (tj. 5-metil-tetrahidrofolat: folna kiselina pretvorena u tetrahidrofolat i dodana s metilnom skupinom), sadrži rizik od oštećenja od antagonizma s folatima (uključujući mijelosupresiju). Nadalje, kortikosteroidima treba dati bolesnike s očnom toksoplazmozom .
Što se tiče trudnica s primarnom infekcijom, liječenje antibioticima može smanjiti rizik od oštećenja fetusa. Posebno, spiramicin se propisuje ako se toksoplazmoza kontrahira tijekom prvog tromjesečja (dobro podnosi i bez toksičnosti za fetus, jer ne prelazi posteljicu) ili kombinacija sulfadiazina, pirimetamina i folne kiseline. Ova posljednja terapijska shema teoretski je učinkovitija ako je fetus već zaražen, ali je toksičniji (pirimetamin se ne smije koristiti tijekom prvog tromjesečja, jer je teratogen). Stoga se ovaj tretman mora provoditi pod strogim liječničkim nadzorom i zahtijeva stalno praćenje krvne slike.
