Razvoj farmakognozije preuzima predmete primijenjene farmaceutske botanike, razmišljanja o lijekovima, a ne o ljekovitoj biljci. Utjecaji endogene i egzogene prirode identificiraju interne čimbenike, koji pripadaju genetskom naslijeđu biljke, čimbenike koji su dio ontogenetskog ciklusa te pojedine vrste, kao i prirodne čimbenike koji utječu na kvalitetu biljke, ali koji se na kraju moraju odraziti na željeni lijek kao njegov zdravi izraz. Svi ti elementi, endogeni i egzogeni, kao i pravilno nazvani čimbenici, uvelike utječu na kvalitetu lijeka i njegove aktivne principe, kako u kvalitativnom tako iu kvantitativnom smislu; zbog toga je kontrola kvalitete vrlo važna i kemijski i biološki.
Brojni čimbenici utječu na kvalitetu lijeka u smislu kemijskog izražavanja, količine i kvalitete aktivnih sastojaka, te u biološkom smislu, u odnosu na njegov izgled, veličinu i zbog toga njegovu morfološku karakterizaciju. Neki primjeri:
Altea officinalis : obitelj Malvacee, koja koristi korijen koji čini lijek. Aktivni principi su sluzi, koja s kemijskog stajališta spadaju u kategoriju heteropolisaharida; to jest, one su molekule ugljikohidrata visoke molekulske mase, s polimernom karakterizacijom gdje su pojedinačni monomeri različiti. Ove sluzi mogu varirati u koncentraciji od 5 do 9%, u usporedbi sa suhom težinom lijeka.
Vještica ljeska : Hamamelis virginiana, obitelj Amamelidacee; grm američkog podrijetla, čiji se listovi uglavnom koriste; aktivni sastojci su tanini, polifenolne molekule visoke molekulske mase s učvršćivanjem, koje se kreću od 1 do 8%.
Belladonna : Atropa belladonna, obitelj Solanaceae; to je ljekovita biljka čiji su listovi bogati alkaloidima; to su molekule koje općenito imaju bazična svojstva u otopini; u Belladonni mogu varirati od 0, 3 do 1% u usporedbi sa suhom masom lijeka.
Artičoka : Cynara scolymus, biljka obitelji Composite čiji se listovi koriste; aktivni principi artičoke pripadaju različitim kategorijama, a flavonoidi mogu varirati u koncentraciji od 0, 5 do 1%.
Sve to ukazuje na to da su endogeni, egzogeni i umjetni čimbenici elementi koji mogu dramatično utjecati na koncentraciju aktivnih principa, čime se na izuzetno značajan način utvrđuje njegova pripadnost zdravstvenom sektoru, a ne "jednostavno" prehrambeni sektor.
Kina : to je tipična biljka Anda, koristi se kora i aktivni principi titriraju u kininu. Kinin je aktivni sastojak koji karakterizira kvalitetu fitokompleksa i koji može varirati od 9 do 12% suhe mase kore; Čimbenici koji utječu na kvalitetu porculana su genetski čimbenici ili egzogeni čimbenici, kao što je visina. Važni su i hibridni: različite vrste, ali slične, prelaze kako bi se dobile hibridne biljke porculana s količinama aktivnih sastojaka blizu maksimalne koncentracije. Također je važna nadmorska visina: ako se porculan uzgaja u ravnici, ona dobro raste, ali ne s ljekovitim svojstvima.
Opijum : lijek karakteriziran koaguliranim lateksom koji potječe od nezrelih kapsula Papaver somniferuma, godišnje kultivirane biljke, čija je kultivacija dopuštena samo u medicinske svrhe i samo u nekim zemljama. Opijum proizvodi vrlo važne alkaloide u području zdravstva, kao što su morfij, ali i mnogi drugi. Koncentracija može varirati od 7 do 20%.
Senna : Cassia senna, grm afričkog podrijetla, uzgaja se iu Indiji; koriste se listovi i plodovi. Aktivni principi, zvani sennosidi, su antrakinoni, molekule s stimulirajućim laksativnim svojstvima; Senna može mijenjati svoj sadržaj aktivnih sastojaka za 50% u usporedbi s faktorima koji nisu samo endogeni, već i klimatski: to je biljka koja živi u vrućoj i suhoj klimi.
