Miris fekalija uglavnom je povezan s procesima truljenja koji utječu na aminokiseline koje su izbjegle crijevnu apsorpciju. Ove hranjive tvari u stvari presreću bakterije debelog crijeva, koje prolaze kroz proces dekarboksilacije koji proizvodi sljedeće toksične amine:
arginin → agmatin
cistin i cistein → merkaptan
histidin → histamin
lizin → kadverin
ornitin → putrescin
tirozin → tiratina
triptofan → indol i scatol
Mnoge od tih supstanci daju fecesu osobito neugodan miris.
Proljev i feces vegetarijanca su slabo mirisni.
Izmet s mirisom ribe ili sperme karakterističan je za bacilarnu dizenteriju, koleru i općenito za mukoroju.
Ukratko, na miris fekalija stoga utječu prehrambene navike (količina proteina, aromatična hrana kao što je češnjak ili luk itd.), Crijevna bakterijska flora, zdravstveno stanje i posebne navike (kao što je pušenje ili duhan za žvakanje)., Općenito, konzumacija malih i dobro izbalansiranih obroka, bez povezivanja važnih količina "nekompatibilnih" namirnica (vidi disociranu prehranu), pomaže u optimizaciji probavnog procesa, smanjujući učestalost poremećaja kao što su meteorizam i nadutost te davanje izmetu odor sui generis.
Svaki slučaj u kojem je loš miris fekalija popraćen simptomima kao što su crna, smola ili blijeda stolica, prisutnost krvi u njima, groznica, zimica, jaki trbušni grčevi, bogata sluz u izmetu i gubitak težine.