Obične aminokiseline i sinteza proteina
Aminokiseline koje se najčešće pojavljuju u proteinskim strukturama živih organizama nazivaju se obične aminokiseline ili proteinogeni. Iako je u prirodi poznato više od 500 vrsta aminokiselina, postoji samo dvadeset vrsta koje nazivamo običnim. Uz to, postoje i neki rijetki, nazvani povremeni, koji općenito proizlaze iz metabolizma običnih nakon ugradnje u lanac proteina. U kolagenu, na primjer, lizin i prolin, dvije uobičajene aminokiseline, nalaze se u hidroksiliranom obliku (hidroksiprolin i hidroksilizin).
Većina ostalih ne-uobičajenih aminokiselina uglavnom pada u sastav enzima i hormona proteinske prirode, ili bolje rečeno peptida (ne zaboravite da se takav protein mora sastojati od više od 100 aminokiselina, dok da se formira oligo i jedan polipeptid je dovoljan od 2 do 9 i od 10 do 100).
Među 20 običnih aminokiselina pamti se
Alanin, arginin, asparagin, asparaginska kiselina, cistein, glicin, glutaminska kiselina, glutamin, histidin, izoleucin, leucin, lizin, metionin, fenilalanin, prolin, serin, treonin, triptofan, tirozin, valin
Primjeri ne-uobičajenih amino kiselina su:
karnitin (uključen u transport masnih kiselina dugog lanca unutar mitohondrija, gdje se koriste za proizvodnju energije);
ornitin, citrulin i homocistein (koji sudjeluju u metabolizmu aminokiselina - ciklus ureje);
hidroksiprolina i hidroksilizina (dio sastava kolagena i nekih proteina);
sarkozin (ili metilglicin).
Neke aminokiseline također mogu imati komercijalnu ili farmakološku važnost.
- Natrijev glutamat se koristi u prehrambenoj industriji kao pojačivač okusa (vidi stock kocka).
- L-dihidroksifenilalanin (L-DOPA) je lijek koji se koristi za liječenje Parkinsonove bolesti.
- 5-hidroksitriptofan (5-HTP) je korišten za liječenje neuroloških simptoma povezanih s fenilketonurijom (nasljedna metabolička bolest koja sprječava uporabu fenilalanina, esencijalne aminokiseline, zbog specifičnih enzimskih nedostataka; nakupljanja fenilalanina u tkivima odgovoran je za ozbiljno oštećenje kože i neurologiju).
Biljke i biljke su sposobne proizvesti određene aminokiseline, koje se mogu naći u peptidnim antibioticima, kao što su nisin i alameticin.
Bitne aminokiseline
Neke od 20 običnih aminokiselina nazivaju se esencijalnim, jer ih tijelo ne može sintetizirati iz drugih spojeva, već ih treba uzeti s hranom.
Za ljude, to su fenilalanin, leucin, isucin, lizin, metionin, treonin, triptofan, valin, a kod djece histidin i arginin.
Obične aminokiseline, kemijska svojstva
Na temelju kemijskih karakteristika radikala R (skupine atoma koji formira ne jako dugi lanac), aminokiseline se mogu podijeliti u različite kategorije.
Aminokiseline s apolarnim R (koje ne mogu tvoriti vodikove veze):
s alifatskim lancem: alanin, leucin, izoleucin, valin, prolin
s aromatskim lancem: fenilalanin, triptofan
s lancem koji sadrži atom sumpora: metionin
Aminokiseline s polarnim R:
sa OH skupinom: serin, treonin, tirozin
sa SH skupinom: cistein
s CO-NH2 skupinom : asparagin, glutamin
s H: glicinom (jedina ne-kiralna aminokiselina)
Aminokiseline s osnovnim R:
lizin, arginin, histidin
Aminokiseline s R kiselinom:
glutaminska kiselina, asparaginska kiselina
