Sjeme kave, tijekom industrijske prerade, također se može koristiti za proizvodnju kave bez kofeina. Ovaj proces, nazvan dekofeinacija, odvija se kada su sjemenke još zelene, a ne nakon pečenja. Mnoge se metode mogu primijeniti za uklanjanje kofeina iz kave, ali sve uključuju uranjanje zelenih sjemenki u vruću vodu (proces poznat kao švicarski vodeni proces) ili paru; u ovom trenutku, dodaju se otapala koja se otapaju i razdvajaju ulja koja sadrže kofein iz sjemena. Dekofeinaciju često primjenjuju prerađivači kave koji kao izvor dodatnog prihoda prodaju kofein farmaceutskim tvrtkama.
