Virus Marburg nosi ime po istoimenom njemačkom gradu, gdje se prvi put pojavio 1967. godine, kada je izazvao tri istovremena izbijanja u Njemačkoj (gradovi Marburg i Frankfurt) te u bivšoj Jugoslaviji (Beograd). U obje zemlje virus Marburga vjerojatno je uveden uvozom ugandskih zelenih majmuna ( Cercopithecus aethiops, također poznat kao sivo-zeleni Cercopiteco).
Prvi slučajevi zabilježeni su među osobljem laboratorija u bliskom kontaktu s tim primatima. Sekundarni slučajevi uključivali su medicinsko osoblje u bolnicama izloženim zaraženom biološkom materijalu.
Nakon toga, zabilježene su sporadične epizode ili epidemije u Južnoj Africi, Keniji, Demokratskoj Republici Kongo i Angoli, ukupno oko 600 slučajeva i 480 smrtnih slučajeva.
