Prevencija malarije uključuje usvajanje različitih ponašanja, uključujući boravak u zaštićenim područjima kada je to moguće, minimizirajući površinu kože izloženu komarcima i korištenjem sredstava za odbijanje insekata i mreža protiv komaraca tijekom noći.
Nadalje, za malariju Svjetska zdravstvena organizacija preporučuje da se profilaksa provodi s atovakon-proguanilom, doksiciklinom i meflokinom . Ovi lijekovi moraju biti propisani od strane liječnika na temelju geografskog područja u kojem se odvijaju, vrste prisutnih parazita i rizika od dobivanja bolesti.
Zbog nastanka plazmodijske otpornosti na antimalarijske lijekove, klorokin je koristan samo za putnike koji idu prema Karibima i Srednjoj Americi sjeverno od Panamskog kanala.