Trenutno ne postoji prikladno cjepivo koje bi spriječilo Marburgsku groznicu . Zbog toga je važno usvojiti ponašanja koja imaju za cilj izbjegavanje zaraze.
Posebice, putnici koji putuju u zemlju u kojoj se odvija epidemija u Marburgu moraju se strogo pridržavati higijenskih praksi, kao što su pranje ruku i izbjegavanje dodirivanja predmeta koji su došli u kontakt s bolesnim ili mrtvim ljudima; u slučaju iznenadne pojave groznice, neophodno je odmah kontaktirati liječnika. Nadalje, Svjetska zdravstvena organizacija preporučuje da se ne jede meso od divljih životinja, kao što su čimpanze ili majmuni.
Kako bi se izbjegli prijenosi, svi sumnjivi slučajevi zahtijevaju strogu izolaciju u opremljenim objektima i usvajanje posebnih postupaka rukovanja, uz uporabu zaštitnih naprava (maske, štitnici za lice, haljine i rukavice).
